<?xml version="1.0"?>
<rdf:RDF xmlns:rdf="http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#" xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/"><rdf:Description rdf:about="https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=144914"><dc:title>Podpora za grafične pospeševalnike v orodju za molekulsko sidranje</dc:title><dc:creator>Kovač,	Miha	(Avtor)
	</dc:creator><dc:creator>Ilc,	Nejc	(Mentor)
	</dc:creator><dc:creator>Sluga,	Davor	(Komentor)
	</dc:creator><dc:subject>molekulsko sidranje</dc:subject><dc:subject>CmDock</dc:subject><dc:subject>grafični pospeševalniki</dc:subject><dc:subject>OpenCL</dc:subject><dc:subject>C++</dc:subject><dc:description>CmDock je odprtokodni program za simulacijo molekulskega sidranja. S pomočjo genetskega algoritma išče optimalno konformacijo manjše molekule, vezane na površino beljakovine. Program smo razširili z dvema izvedbama nove cenilne funkcije na osnovi odsekoma linearnega potenciala. Prva se izvaja na enem jedru centralne procesorske enote, druga pa izkorišča zmožnost vzporednega računanja na grafičnih pospeševalnikih in gradi na prototipu v ogrodju OpenCL. Rezultate nove cenilne funkcije smo primerjali z rezultati obstoječe, pri čemer smo ocenjevali točnost ter hitrost izračuna na treh izbranih testnih kompleksih. Pri enem izmed njih je rezultat bolj točen, pri ostalih dveh pa zaostajamo za obstoječo cenilno funkcijo. Izvajanje programa je z novo cenilno funkcijo na grafičnem pospeševalniku 3-krat hitrejše kot na centralni procesorski enoti ter 8-krat hitrejše kot z obstoječo cenilno funkcijo. Del, ki se v celoti izvede vzporedno, porabi na grafičnem pospeševalniku do 76-krat manj časa.</dc:description><dc:date>2023</dc:date><dc:date>2023-03-22 14:05:05</dc:date><dc:type>Diplomsko delo/naloga</dc:type><dc:identifier>144914</dc:identifier><dc:language>sl</dc:language></rdf:Description></rdf:RDF>