<?xml version="1.0"?>
<rdf:RDF xmlns:rdf="http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#" xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/"><rdf:Description rdf:about="https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=142017"><dc:title>Načrtovanje uravnavanja transkripcije preko medsebojnega vpliva DNA-vezavnih proteinov</dc:title><dc:creator>Leben,	Katja	(Avtor)
	</dc:creator><dc:creator>Jerala,	Roman	(Mentor)
	</dc:creator><dc:subject>Uravnavanje transkripcije</dc:subject><dc:subject>sintezna biologija</dc:subject><dc:subject>DNA alosterija</dc:subject><dc:subject>TALE</dc:subject><dc:subject>efektor podoben transkripcijskemu aktivatorju</dc:subject><dc:subject>ojačanje transkripcije</dc:subject><dc:subject>ojačanje vpliva transkripcijskega dejavnika</dc:subject><dc:description>Narava uravnava številne celične procese z vplivom na izražanje genov. Prepisovanje DNA v evkariontskih celicah sproži medsebojno delovanje pestrega nabora proteinov. Poznavanje njihovega kooperativnega delovanja je pomembno za načrtovanje uravnavanja celičnih procesov v sintezni biologiji. Razumevanje tega procesa odpira možnosti načrtovanja novih regulatornih vezij. V doktorskem delu smo preiskovali vpliv efektorja, podobnega transkripcijskemu aktivatorju (TALE), ki poveča aktivnost transkripcijskega dejavnika, vezanega tudi več deset baznih parov stran. Uporabljeni proteini TALE niso vsebovali lastne aktivacijske domene in so ojačali delovanje drugega transkripcijskega dejavnika ne glede na orientacijo, položaj navzgor ali navzdol od vezavnega mesta transkripcijskega dejavnika in razmik med vezavnima mestoma. Vpliv proteina TALE na transkripcijo smo demonstrirali na različnih sesalskih celičnih linijah, v kombinaciji s tremi različnimi DNA vezavnimi domenami, tako za aktivatorje kot represorje transkripcije. Določili smo najkrajšo razdaljo pri kateri se pojavi vpliv na drugi transkripcijski dejavnik in okarakterizirali razpon razdalj med vezavnima mestoma, kjer je vpliv še opazen. V prvem delu doktorata smo predstavili sistem za preverjanje sinergističnega delovanja proteina TALE z več različnimi DNA vezavnimi proteini. Predvidevamo, da bi lahko preko tega učinka izboljšali razumevanje kooperativnega delovanja in vloge DNA pri uravnavanju izražanja genov. Odkritje, da proteini TALE povečajo uravnavanje transkripcije z drugim transkripcijskim dejavnikom, širi raznolikost načinov na katere lahko proteini TALE vplivajo na transkripcijo in bi lahko delovali kot dodatni modulator pri uravnavanju transkripcijskih poti. Proteini s poznanim kooperativnim delovanjem predstavljajo zanimiv potencial v kontekstu sintezne biologije. Poleg tega poznavanje vpliva TALE na učinkovitost drugih transkripcijskih dejavnikov predstavlja DNA vezavni protein z okarakteriziranimi kooperativnimi lastnostmi in orodje za nadaljnje preiskovanje mehanizmov medsebojnega delovanja proteinov pri uravnavanju transkripcije in izkoriščanje njihovega potenciala.</dc:description><dc:date>2022</dc:date><dc:date>2022-10-16 07:15:27</dc:date><dc:type>Doktorsko delo/naloga</dc:type><dc:identifier>142017</dc:identifier><dc:language>sl</dc:language></rdf:Description></rdf:RDF>