Genotipizacija sevov vrste Escherichia coli, ki izločajo betalaktamaze z razširjenim spektrom delovanja, izoliranih iz hemokultur in nadzornih kužninGobec, Nika (Avtor) Ambrožič Avguštin, Jerneja (Mentor) Pirš, Mateja (Komentor) Escherichia colibetalaktamazeESBLgenotipizacijanadzorna kužninahemokulturaV naši raziskavi smo analizirali 132 ESBL-pozitivnih izolatov E. coli, vzorčenih pri 66 bolnikih iz Osrednjeslovenske regije in izoliranih na Inštitutu za mikrobiologijo in imunologijo Medicinske fakultete Univerze v Ljubljani. V raziskavo smo vključili izolate bolnikov, pri katerih je bila ESBL-pozitivna E. coli najprej osamljena iz nadzorne kužnine, kasneje pa iz krvi. Z metodo ERIC-PCR smo izolate uvrstili v 33 skupin z različnimi ERIC-profili. Z analizo filogenetskih skupin po Clermontu smo ugotovili, da se 78,8 % izolatov iz hemokultur in 75,8 % izolatov iz nadzornih kužnin uvršča v filogenetsko skupino B2. V 53 % primerov (35) je bil izolat iz nadzorne kužnine enak izolatu iz krvi, od teh pa je bilo 80,6 % E. coli ST131. Zanimalo nas je, kakšna je genotipska razlika med izolati, ki kolonizirajo črevesje in niso vir za bakteriemijo ali sepso, ter izolati, ki jih najdemo v črevesju in krvi. Za slednje izolate so statistično značilni: gen za aerobaktin (82,3 %), kapsularni gen kpsMTII (82,3 %), zapis za avtotransporter sat (84,2 %), genotoksin usp (69,4 %) ter zapisa za adhezine iha (69,4 %) in afa/dra (40,3 %). Na podlagi prisotnosti teh genov bi z genotipizacijo črevesnih izolatov lahko odkrili tiste, pri katerih je tveganje za razvoj težje potekajočih izvenčrevesnih okužb z ESBL-E. coli zaradi lastnosti samega bakterijskega izolata, večje.[N. Gobec]20222022-09-28 07:16:42Magistrsko delo/naloga141282sl