Dinamika porazdelitve pre-rRNA v jedrcu med celičnim ciklom v embrionalnih matičnih celicah.Trupej, Anja (Avtor) Ogorevc, Jernej (Mentor) Modic, Miha (Komentor) Jedrceprekurzorsko ribosomska RNAmišje embrionalne matične celicemitotski kondenzatiCRISPR-dCas13dHyProJedrce, biomolekularni kondenzat, je ključnega pomena pri sintezi sestavnih RNA ribosomskih komponent in glavno mesto zorenja ribosomov. Težnja po količini proteinov se spreminja tekom celične diferenciacije. Embionalne matične celice (EMC) za ohranjanje razvojne plastičnosti in zagotavljanja zadostnega števila predniških celic zahtevajo večje količine proteinov kot somatske celice. Sorazmerno s količino proteinov narašča tudi število zrelih ribosomov, ki so rezultat večjega števila aktivno prepisanih ribosomskih genov (rDNA) v jedrcu. Pomanjkanje raziskav na področju prekurzorskih ribosomskih molekul RNA (pre-rRNA) v delečih se EMC preprečuje celostno razumevanje njihove dinamike in vrednotenja pomena pri vzdrževanju pluripotentnosti. Za uporabo različnih metod vizualizacije tarčnih molekul pre-rRNA v mišjih EMC se je hibridizacijski pristop izkazal za najprimernejšega. S slednjim smo odkrili dosedaj neopažene kondenzate v središču mitotskih kromosomov in uspeli dokazati njihovo prostorsko ujemanje z novo nastajajočimi molekulami RNA. Vpogled v interakcijsko mrežo molekul RNA mitotskega kondenzata nam je omogočila tehnika označevanja okolice tarčnih RNA, HyPro, s katero smo identificirali številne majhne RNA v jedrcu (snoRNA) udeležene v procesu zorenja pre-rRNA. Prostorska prepletenost prekurzorskih ribosomskih prepisov RNA in snoRNA, pri kateri izstopa snord3b-ps2, kaže na novo funkcijo ribosomskih genov v delečih se EMC in zamaje temelje dosedanjih prepričanj o pomenu mitotskih prepisov pre-rRNA.20222022-09-21 07:17:52Magistrsko delo/naloga140883sl