Uporaba transkriptomike na nivoju posamezne celiceŠkoda, Neža (Avtor) Jakše, Jernej (Mentor) transkriptomika posamezne celicemikropretočni sistemiIlluminauporaba transkriptomikeTranskriptom so vse molekule RNA v celici ali tkivu. Transkriptomika je veda, ki preučuje transkriptom in pomaga pri razumevanju regulacije izražanja genov in bioloških procesov. Sekvenciranje transkriptoma iz tkiv pokaže izražanje genov velikega števila celic. Transkriptomika na nivoju posamezne celice pa omogoča vpogled v gensko izražanje ene celice. Ponuja boljši prikaz razlik med posameznimi celicami in njihovimi funkcijami. Da se lahko spustimo na raven ene celice moramo celice najprej ločiti med sabo. Preučujemo lahko specifične redke celične tipe ali pa obdelamo veliko število celic naenkrat. Celice lahko ločujemo tudi po velikosti in s pomočjo fluorescence, glede na njihove molekularne markerje. Prepise pridobljenih posameznih celic unikatno označimo in pripravimo knjižnico za sekvenciranje. Sekvenciramo z visokozmogljivimi tehnologijami, ki delujejo na principu sekvenciranja s sintezo. Pridobljene podatke nato računalniško obdelamo. Obstaja tudi metoda sekvenciranja transkriptoma posameznih jeder, ki omogoča raziskovanje celic, ki jih je težko izolirati iz tkiva in zamrznjenih vzorcev. Metoda preučevanja transkriptoma na nivoju ene celice se uveljavlja na številnih področjih. V raziskavah zgodnjega embrionalnega razvoja omogoča vpogled v uravnavanje izražanja genov že v fazi morule. V nevroznanosti omogoča spremljanje diferenciacije celic. Pri razvoju tumorjev je omogočila iskanje novih tarč za zdravila pri redkih populacijah celic. Uveljavlja se v raziskavah rastlin.20222022-09-11 07:17:31Diplomsko delo/naloga140113sl