Učinkovitost izolacije DNA iz različnih človeških tkiv ter bakterijske DNA iz brisa ustne sluznice z avtomatizirano metodo na osnovi magnetnih kroglicBuneto, Špela (Avtor) Ambrožič Avguštin, Jerneja (Mentor) Pajič, Tadej (Komentor) molekularna genetikaizolacija nukleinskih kislinkritkivo FFPEplodovo tkivocfDNAbakterijska DNAkoličina DNAčistost DNAučinkovitost izolacijeIzolacija ustrezno čiste in kakovostne deoksiribonukleinske kisline (DNA) je predpogoj za nadaljnje analize, ki so pomembne za diagnosticiranje bolezni, napovedovanje zdravljenja, spremljanje učinka zdravljenja ter izboljšanje kakovosti življenja posameznika. Na Kliničnem inštitutu za genomsko medicino (KIGM) v Univerzitetnem kliničnem centru v Ljubljani, zagotavljajo možnosti diagnostike in genetskega svetovanja bolnikom in družinam z genetsko pogojenimi boleznimi. S strokovnim in raziskovalnim delom omogočajo prenos najsodobnejših spoznanj v vsakodnevno obravnavo genetsko pogojenih bolezni na področjih, kot so genetska epidemiologija bolezni, ki je pomembna za javno zdravstvo, moške in ženske neplodnosti in nevrogenetike, vključujoč tudi raziskovanje povezanosti mikrobioma z nevrodegenerativnimi boleznimi. Na KIGM vrsto let izvajajo osamitev DNA iz različnih bioloških vzorcev s komercialno dostopnimi reagenčnimi kompleti. Zadnja leta pa želijo povečali pretočnost izolacije DNA in razširili nabor vzorcev, iz katerih bi lahko pridobili zadostne količine kakovostne molekule DNA. Zaradi tega smo se odločili, da v sklopu magistrske naloge preverimo učinkovitost aparata ChemagicTM360, ki omogoča avtomatiziran način izolacije zelo čistih in visokokakovostnih molekul DNA iz različnih človeških vzorcev, kot tudi bakterijske DNA iz brisa ustne sluznice. Z raziskavo smo želeli preveriti, ali je izolacija z avtomatizirano metodo primerljiva z že vpeljanimi metodami izolacije. Z analizami merjenja količin, čistosti in preverjanja učinkovitosti izolacije DNA smo ugotovili, da je avtomatizirana metoda primerljiva z izbranimi, v laboratoriju že vpeljanimi, metodami izolacije in je ustrezna za uporabo v rutinski genetski diagnostiki.[Š. Buneto]20222022-06-10 07:15:04Magistrsko delo/naloga137298sl