Identifikacija mikro RNA in njihovih tarč v obrambnem odzivu hmelja (Humulus lupulus L.) po okužbi z glivo Verticillium nonalfalfaeKunej, Urban (Avtor) Štajner, Nataša (Mentor) hmeljHumulus lupulusVerticillium nonalfalfaeobrambni odzivodpornost rastlinfitopatogene gliveV okviru raziskav doktorske disertacije smo izvedli umetno inokulacijo odpornega in občutljivega kultivarja hmelja s fitopatogeno glivo Verticillium nonalfalfae ter v različnih časovnih točkah po inokulaciji določili profil fenolnih spojin in glivne kolonizacije. Ugotovili smo, da se v koreninah občutljivega kultivarja pojavlja bimodalen vzorec kolonizacije, prav tako pa se je gliva razširila v stebla, medtem ko se je relativna količina glive v odpornem kultivarju tekom eksperimenta zmanjševala. V koreninah odpornega kultivarja smo tretji dan po inokulaciji zaznali statistično značilno povečanje skupnih flavanolov. V steblih je bila akumulacija fenolov v občutljivem kultivarju v primerjavi z odpornim višja, saj smo zaznali znatno povečanje flavonolov 3. in 15. dan ter hidroksicimetnih kislin 6. dan po inokulaciji. Študija identifikacije, karakterizacije, filogenetske analize in analize izražanja treh genov Argonavt ter dveh genov Dicerju-podobnih proteinov in dveh genov od RNA-odvisne RNA polimeraze je pokazala grozdenje z njihovimi ortologi iz ožje sorodnih vrst Cannabis sativa, Morus notabilis in Ziziphus jujuba. Ugotovili smo, da se tretji dan po inokulaciji znatno zniža izražanje AGO2 pri obeh kultivarjih, kar lahko povzroči zmanjšano post-transkripcijsko utišanje genov, ki ga posredujejo AGO2 vezane male RNA. Prav tako smo opazili zmanjšano izražanje AGO7 pri občutljivem kultivarju prvi dan po inokulaciji in zmanjšano izražanje RDR6 pri odpornem kultivarju tretji dan. Slednje nakazuje na morebitno zavrtje biogeneze trans-delujočih malih RNA. V študiji identifikacije in diferenčnega izražanja miRNA smo odkrili 56 znanih in 43 novih miRNA. Kot odziv na okužbo z V. nonalfalfae smo zaznali spremembe v izražanju petih znanih in dveh novih miRNA v občutljivem kultivarju ter šestih znanih miRNA v odpornem kultivarju. Diferenčno izražene miRNA predvidoma utišajo 49 transkriptov, ki so pri občutljivem kultivarju vključeni v lokalizacijo proteinov in sintezo pigmentov, medtem ko so pri odpornem kultivarju vključeni v regulacijo transkripcijskih faktorjev in hormonsko signalizacijo.[U. Kunej]20212021-12-29 07:15:47Doktorsko delo/naloga134200sl