Egerolizini kot molekularno orodje za odkrivanje ceramid fosfoetanolamina, biološkega označevalca s parodontalno boleznijo povezanih bakterijMunjaković, Haris (Avtor) Skočaj, Matej (Mentor) Gašperšič, Rok (Komentor) egeroliziniparodontalna bolezenceramid fosfoetanolaminEryAmolekularni označevalciEgerolizini so majhni (~13-20 kDa), β-strukturni proteini, katerih skupna lastnost je ta, da prepoznajo različne lipide oz. lipidne domene, ki gradijo biološke membrane. Za nekatere glivne egerolizine je znano, da se specifično in močno vežejo na ceramid fosfoetanolamin (CPE). Gre za lipid iz skupine sfingolipidov, ki predstavlja karakteristični lipid v celičnih membranah po Gramu negativnih bakterijskih vrst iz debla Bacteroidetes. Opredelitev mikrobne združbe bakterijskih zobnih oblog, biofilma iz subgingivalnega prostora pacientov s parodontalno boleznijo kaže na pomen bakterij iz debla Bacteroidetes, kot ključnih v sami patogenezi bolezni. V klinični praksi se kaže potreba po razvoju robustnih diagnostičnih metod v začetnih fazah bolezni. Ena izmed potencialnih molekul, ki bi lahko predstavljala biološki označevalec za odkrivanje parodontalne bolezni je lipid CPE. Zaradi specifične in močne interakcije med egerolizini in CPE, kaže ta vrsta proteinov izjemen potencial kot molekularno orodje v diagnostiki bolezni, ki je sicer povezana z višjimi ravni lipida CPE. S tem namenom smo z uporabo erilizina A z metodama tankoplastne kromatografije in točkovnim nanosom lipidov kvalitativno opredelili prisotnost lipida CPE v kliničnih vzorcih posameznikov s parodontalno boleznijo ter pri parodontalni bakteriji Porphyromonas gingivalis. Hipotezo o prisotnosti CPE pri bakteriji P. gingivalis smo z natančno lipidomsko analizo potrdili s tandemsko masno spektrometrijo z elektrorazpršilno ionizacijo (LC-ESI-MS/MS) in jedrsko magnetno resonanco (NMR).[H. Munjaković]20212021-11-20 07:15:02Magistrsko delo/naloga133308sl