Struktura in vloga proteina E v virusu SARS-CoV-2Černenšek, Nikol (Avtor) Podlipnik, Črtomir (Mentor) SARS-CoV-2protein Eionski kanalviroporinzaviralci kationskega kanalaSARS-CoV-2 je nov virus, ki je z veliko hitrostjo obšel ves svet. Zaradi njegove hitre prenosljivosti iz človeka na človeka je bila v marcu 2020 razglašena globalna pandemija. Ker se ljudje do sedaj še niso srečali s tem virusom, se je pod vprašaj postavilo kakšne strategije ubrati proti zajezitvi tega virusa in kako zagotoviti uspešno zdravljenje bolezni pod imenom COVID-19, ki jo virus povzroča. Ena od strategij, ki se jo uporablja je, da se ugotovi tarčno mesto v virusu na katero se lahko terapevtska učinkovina veže. Ena od možnosti so proteini, ki virusu omogočajo pomembne funkcije, kot je vstop v celico, pomoč pri virusni sestavi in zorenju virusa ter virusovi patogenezi. Protein E v SARS-CoV-2 se smatra kot ena izmed potencialnih terapevtskih tarč. Glede na dosedaj že obsežno znanje o koronavirusih se za protein E meni, da ima podobno pomembne funkcije kot pri drugih koronavirusih, ter da lahko zajezitev ali odprava le-tega močno oslabi virus. Kot najmanjši strukturni protein v SARS-CoV-2 se nahaja v membrani virusa in posreduje pri različnih virusnih mehanizmih in interakcijah. Njegovo pomembnost tudi v veliki meri povezujejo z virusovo patogenezo. Po vstopu v celico, kjer se lokalizira predvsem na celične transportne predele gostiteljeve celice, ima sposobnost tvorbe pentamerne strukture, ki deluje kot viroporin v korist virusa. Kot monomer obsega tri domene: i.) kratka hidrofilna N-končna regija, ii.) hidrofobna transmembranska domena (TMD) in iii.) dolga hidrofilna C-končna regija. Nekatere proteine je težko izolirati in je zato raziskava njihovih struktur in mehanizma otežena. Nadaljnje raziskave so se usmerile k uporabi različnih tehnik in metod za pridobitev boljšega vpogleda v strukturo in razumevanja mehanizma delovanja SARS-CoV-2 proteina E.20212021-10-08 14:25:00Diplomsko delo/naloga132009sl