Postavitev modela razmerja med strukturo in afiniteto peptidnega liganda regije Fc imunoglobulinov GVuga, Laura (Avtor) Bratkovič, Tomaž (Mentor) protitelesafagiE.coliELISApeptidni ligandiV tem delu so opisani postopki načrtovanja ter optimizacije peptidnih ligandov Fc regije imunoglobulinov G. Peptidne ligande smo izrazili na bakteriofagnem nosilcu v obliki monovalentne predstavitve. Opisani so postopki transformacije, gojenja ter izolacije rekombinantnih fagmidnih delcev. Relativno afiniteto različic peptidnih ligandov do humanih IgG smo določili z encimskoimunskim testom. Optimizirali smo sestavo pufrov za spiranje, blokiranje ter redčenje vzorcev, nato pa tudi testirali različne titre fagov, na podlagi česar smo določili optimalne pogoje, ki smo jih uporabili pri nadaljnjih testih. Fagmid, na katerem smo peptidne ligande izražali, smo tekom dela spremenili ter optimizirali. S tem smo uspeli precej znižati vrednosti nespecifične adsorpcije fagov, kar je znatno izboljšalo resolucijo rezultatov. Na koncu smo tako pridobljene peptidne ligande primerjali s starševskim peptidom in na podlagi rezultatov izvedli analizo povezave med strukturo in aktivnostjo (oz. afiniteto; angl. structure-activity relationship, SAR). Starševski peptid smo uspeli optimizirati, analiza SAR pa nam je dala izsledke, ki bodo uporabni za nadaljnje raziskave ter optimizacijo alternativnih ligandov Fc regije IgG.[L. Vuga]20212021-10-01 10:22:04Magistrsko delo/naloga131712sl