Ugotavljanje virusov Borna pri nekaterih izbranih vrstah sobnih in prostoživečih pticVelepec, Vid (Avtor) Narat, Mojca (Mentor) Račnik, Joško (Komentor) virusivirus BornapapigelabodiPDDmolekularne metodeqRT-PCRPtičji virusi Borna ali ABV (Avian bornavirus) okužujejo različne vrste ptic. Pri papigah v ujetništvu lahko povzročajo bolezen razširitve žleznega dela želodca (angl. proventricular dilatation disease, PDD). Z našo raziskavo smo želeli preveriti, ali je ABV prisoten pri nekaterih vrstah ptic v Sloveniji. V ta namen smo testirali vzorce iz 62 udomačenih papig različnih vrst in 250 prostoživečih labodov grbcev. Za dokazovanje virusne RNK (ribonukleinske kisline, angl. RNA ribonucleic acid) v vzorcih ptic smo uporabili metodi RT-PCR in RT-PCR v realnem času. Za ugotavljanje kakovosti odvzetega vzorca smo v preiskavo vključili interno kontrolo 18S rRNK (ribosomalne RNK), s katero smo lahko spremljali vsebnost evkariontske 18s RNK v vzorcu in se tako izognili lažno negativnim rezultatom zaradi slabo odvzetih vzorcev. V raziskavi smo ABV ugotovili pri 15 od 45 živih/bolnih papigah (33 %) in pri sedmih od 17 (41 %) papigah, ki so poginile. S primerjavo sekvenc smo odkrili, da so bile okužene papige pozitivne na genotip PaBV-4, ki spada v vrsto Psittaciform 1 orthobornavirus. Analizirali smo vzorce 250 poginjenih labodov grbcev. ABV RNK smo odkrili pri petih labodih (2 %). S sekvenciranjem smo pri ABV pozitivnih labodih grbcih ugotovili genotip ABBV-1, ki spada v vrsto Waterbird 1 orthobornavirus. Iz dobljenih rezultatov lahko sklepamo, da so v Sloveniji ABV prisotni pri nekaterih papigah v ujetništvu in labodih grbcih in da sta obe metodi, ki smo ju uporabili, hitri, občutljivi in zadovoljivo specifični, zato sta primerni za izvajanje rutinske diagnostike pri pticah.[V. Velepec]20212021-10-01 10:21:44Magistrsko delo/naloga131707sl