Profil izražanja kandidatnih genov pri posameznih tipih kromatofor potočne postrvi (Salmo trutta)Renko, Gašper (Avtor) Sušnik Bajec, Simona (Mentor) Djurdjevič, Ida (Komentor) ekspresija genovpobočnicabiopsijapotočna postrvpigmentacijakromatoforeZa potočno postrv (Salmo trutta, Linnaeus 1758 ) je značilen vzorec črnih in rdečih pik na koži. Rdeče pike so razporejene predvsem v bočni regiji ob pobočnici. Nedavno so v regiji rdečih pik na koži postrvi opisali nov tip eritrofor (tip 2), ki se razlikujejo od eritrofor tipa 1, ki so poleg številnih melanofor prisotne v črni piki. Koža v regiji rdečih pik ima tudi zelo specifičen profil izražanja mnogih genov, povezanih s pigmentacijo. To specifično izražanje bi lahko povezali z eritroforami tipa 2, ki kožo rdeče obarvajo. Da bi to potrdili, je potrebno določiti profil izražanja genov le-tega tipa celic. Kromatofore iz kože je potrebno osamiti od preostalih celic v koži. Optimizirali smo postopek izolacije in odvzema kromatofor iz kože postrvi in kot prvi predstavili protokol za izolacijo posameznih pigmentnih celic iz kože potočne postrvi, pri čemer ni potrebno žrtvovati živali. Z uporabo protokola smo uspeli osamili eritrofore tipa 1, eritrofore tipa 2 in melanofore iz različno obarvanih regij kože. Iz odvzetih celic smo izolirali RNA in s qPCR analizirali izražanje desetih genov s potrjeno vlogo v pigmentaciji in treh genov povezanih s pobočnico. Kljub majhnemu vzorcu in statistično nepodprtim rezultatom menimo, da ima vsak tip kromatofor, vključno z obema tipoma eritrofor, zanj specifičen profil izražanja genov. Na podlagi rezultatov in opažanj, povezanih z rdečo pigmentacijo, smo postavili hipotezo, da rdeče pike oz. eritrofore tipa 2 sodelujejo pri zaznavanju zunanjih dražljajev.[G. Renko]20212021-09-12 07:16:36Magistrsko delo/naloga130254sl