Bioinformacijska analiza v diagnostiki z uporabo tehnologije nanoporePajk, Tilen (Avtor) Jakše, Jernej (Mentor) nanoporeMinIONdiagnostikasekvenciranjebioinformatikaNanopore sekvenciranje je perspektivna nova tehnologija z začetki uporabe v prejšnjem tisočletju. Deluje na podlagi zaznavanja sprememb v toku, ki teče skozi poro v membrani. Spremembe toka povzroča prehajanje molekule skozi nanoporo, ki je vezana v membrano. Oxford Nanopore Technologies je podjetje, ki je odgovorno za mnogo napredkov na tem področju in je leta 2014 izdalo napravo MinION, ki ponuja mnoge prednosti pred ostalimi metodami sekvenciranja nove generacije. Čeprav so imele začetne različice težave z doseganjem visoke natančnosti, so izboljšave naprave to dvignile do standardov, ki so postavljene pri ostalih tehnologijah nove generacije. Zahteve moderne diagnostike se pomikajo stran od tradicionalnih metod proti hitrejšim tehnologijam, ki lahko rezultate podajo v krajšem ali celo realnem času. Nanopore tehnologija se je dokazala kot nepogrešljiva pri spremljanju in ukrepanju v mnogih izbruhih ebole in drugih tropskih bolezni, kjer so fizične lastnosti in zmogljivosti MinION-a ekipam omogočile sekvenciranje na prej nedostopnih lokacijah in s tem izboljšale nadzor situacije ter omogočile natančnejši vpogled v spreminjanje patogenov skozi potek izbruhov. Hitrost sekvenciranja, zmogljivost podajanja rezultatov v realnem času, lahka uporaba in prenosljivost, so razlogi, da se MinION naprava vedno več uporablja v diagnostične namene za živali, rastline in druge vrste povsod po svetu.[T. Pajk]20212021-08-29 07:15:27Diplomsko delo/naloga129193sl