Izražanje transkripcijskega dejavnika NANOG pri predrakavih spremembah in ploščatoceličnem raku ustne votlineGrubelnik, Gašper (Avtor) Zidar, Nina (Mentor) Boštjančič, Emanuela (Komentor) ploščatocelični rak ustne votlineploščatocelične intraepitelijske spremembe ustne votlineNanogtranskripcijski dejavnikdiagnostični označevalecPloščatocelični rak (PR) ustne votline se razvije preko ploščatoceličnih intraepitelijskih sprememb (PIS) kot posledica večstopenjskega procesa kopičenja somatskih mutacij in spremenjenega izražanja različnih genov, med katerimi je tudi NANOG. NANOG je transkripcijski dejavnik, ki je ključen v embrionalnem razvoju, kasneje pa sodeluje v razvoju različnih malignomov. Raziskali smo vlogo in diagnostični pomen ter regulacijo NANOG na proteinskem, RNA in DNA nivoju v PIS in PR ustne votline. V raziskavo smo vključili 367 biopsijskih tkivnih vzorcev 172 bolnikov s PR in PIS ustne votline ter 30 vzorcev normalne ustne sluznice. Uporabili smo imunohistokemijo, qPCR in sekvenciranje po Sangerju. Na nivoju mRNA je bil NANOG izražen v vseh vzorcih, izražanje je bilo najnižje v normalni sluznici in najvišje v PIS visoke stopnje, v PR se je izražanje ponovno znižalo. Protein v normalni sluznici ni bil izražen, ponovno se je aktiviral v procesu kancerogeneze, intenzivnost je naraščala od blede reakcije v PIS nizke stopnje do močnega izražanja v PIS visoke stopnje in PR. Regulatorne miRNA in lncRNA so pokazale korelacijo z izražanjem NANOG. Spremenjenega števila kopij NANOG in spremenjene metilacije promotorja NANOG nismo zaznali. Naši rezultati kažejo, da se izražanje NANOG na nivoju proteina utiša pred rojstvom in se ponovno izrazi v PIS visoke stopnje in PR, zato bi ga lahko uporabili kot diagnostični označevalec za natančnejšo opredelitev PIS. V procesu kancerogeneze se je izražanje NANOG mRNA razlikovalo od izražanja proteina NANOG, kar kaže na pomembno vlogo regulacije na posttranskripcijskem nivoju, z miRNA in lncRNA, poleg mRNA proteinskih regulatorjev kot ključnih regulatornih mehanizmov. Metilacija promotorja in spremenjeno število kopij imata pri regulaciji NANOG manjšo vlogo. Ugotovili smo tudi, da morfološko normalna sluznica ob raku že kaže spremembe v izražanju NANOG in njegovih regulatorjev in se torej pomembno razlikuje od morfološko normalne sluznice zdravih oseb. Z raziskavo smo prispevali nova spoznanja o vlogi NANOG v procesu razvoja PR ustne votline.20212021-06-02 08:15:01Doktorsko delo/naloga127279sl