Ocena povezanosti genskih polimorfizmov rs2296533 in rs7984870 z izražanjem gena RANKL v kostnem tkivuHorvat, Patricija (Avtor) Marc, Janja (Mentor) Prodan Žitnik, Irena (Komentor) osteoporozaosteoartrozaRANKLPCR-TaqManPodatki kažejo, da sta najpogostejša presnovna bolezen kosti, osteoporoza, in najpogostejša degenerativna bolezen sklepov, osteoartroza, verjetno povezani z motnjami v regulatornem sistemu OPG/RANK/RANKL. RANKL, osrednja tema te magistrske naloge, je protein, odgovoren za aktivnost, diferenciacijo in preživetje osteoklastov in s tem posledično za proces kostne premene. Pri omenjenih boleznih namreč povečano izražanje gena RANKL pospeši osteoklastogenenzo in razgradnjo kostnine. V genu za RANKL so odkrili številne genetske variacije, ki vplivajo na sintezo in/ali aktivnost tega proteina. Namen te naloge je bil ugotoviti, ali polimorfizma rs2296533 (SNP 1) in rs7984870 (SNP 2) vplivata na izražanje gena RANKL v humanem kostnem tkivu bolnikov z osteoporozo in osteoartrozo. V raziskavo smo vključili 166 slovenskih preiskovancev, ki smo jih razdelili v 3 skupine: preiskovanci z osteoporozo (OP) (n = 75), preiskovanci z osteoartrozo (OA) (n = 54) in zdravi preiskovanci (n = 24). DNA smo izolirali iz vzorcev krvi ter izvedli analizo dveh enonukleotidnih polimorfizmov (SNP), in sicer SNP 1 in SNP 2. Za analizo obeh polimorfozmov smo uporabili genotipizacijo s PCR-TaqMan sondami. Določili smo alelne in genotipske frekvence SNP 1 in SNP 2 slovenskih preiskovancev in ovrednotili njun klinični pomen. Ugotovili smo, da so bile genotipske frekvence pri obeh polimorfizmih primerljive (TT : TC : CC = 22,3 : 57,2 : 20,5 za SNP 1 in GG : GC : CC = 22,3 : 57,8 : 19,9 za SNP 2) ter da so se pari genotipov pojavljali sočasno, in sicer v 99,4 %. Redkejši alel je bil alel C (za oba SNP) in se je pojavljal z alelno frekvenco 49,1 % v primeru SNP 1 in 48,8 % v primeru SNP 2. Frekvenci genotipov nakazujeta vezano dedovanje obeh SNP skupaj, zato nas je zanimalo, ali tudi enako vplivata na izražanje gena za RANKL. Statistična analiza Kruskal-Wallisovega testa je pokazala, da se izražanje gena RANKL statistično značilno ne razlikuje v odvisnosti od genotipa, se pa statistično značilno pričakovano razlikuje v odvisnosti od diagnoze v primeru obeh SNP, in sicer je pri OP in OA pričakovano značilno višje. Zaključimo lahko, da je povečano izražanje gena RANKL pri preiskovancih z osteoporozo signifikantno v primerjavi z zdravimi preiskovanci. Pri preiskovancih z osteoartrozo pa smo ugotovili le statistično značilno večjo frekvenco mutiranega alela v primerjavi z zdravimi preiskovanci. Oba zaključka nakazujeta, da proučevana genetska polimorfizma v genu za RANKL prispevata h genetski nagnjenosti k osteoartrozi in osteoporozi.20202020-11-07 08:45:02Magistrsko delo/naloga121911sl