Vpliv enonukleotidnih polimorfizmov v kandidatnih genih na pigmentni vzorec pri postrvihBrajnik Kovačič, Zala (Avtor) Sušnik Bajec, Simona (Mentor) Zorc, Minja (Komentor) ribepostrvipigmentni vzorecgenetikakandidatni genipolimorfizemSorodni vrsti, soška (Salmo marmoratus) in potočna postrv (Salmo trutta), se izrazito razlikujeta glede na vzorec v koži – pri soški postrvi najdemo labirinten, pri potočni postrvi pa pikčast vzorec. Z obsežnimi bioinformacijskimi analizami in ob dostopnosti dobro anotiranega genoma potočne postrvi smo prišli do velikega števila genov z nesinonimnimi mutacijami, ki so lahko kandidatni geni za pigmentacijo. Med vsemi identificiranimi polimorfizmi med soško in potočno postrvjo smo izbrali kandidatne enonukleotidne polimorfizme za preverjanje v laboratoriju in nadaljnje raziskave. Z analizo s pomočjo zbirke bioloških poti KEGG smo kandidatne gene razporedili med biološke poti. Poti z največjim številom takšnih genov so bile: (1) presledkovni stiki, (2) tesni stiki, (3) adherentni stiki, (4) fokalna adhezija in (5) regulacija aktinskega citoskeleta. V okviru magistrske naloge smo potrdili prisotnost zaznanih enonukleotidnih sprememb ob primerjavi večjega števila vzorcev čiste soške in potočne postrvi. Štiri gene s potrjenimi polimorfizmi, ki striktno ločujejo soško in potočno postrv, smo uporabili za genotipizacijski test različnih križancev med vrstama, za katere so značilni zelo različni pigmentni vzorci. Dokazali smo, da je pri križancih med soško in potočno postrvjo jasno nakazana povezava med pigmentnim vzorcem in genotipom vsaj enega od testiranih kandidatnih genov, amotl2a.20202020-09-19 07:15:29Magistrsko delo/naloga120379sl