Študija zaviralcev amiloidnih bolezni z vibracijsko spektroskopijoKelhar, Tim (Avtor) Zorko, Andrej (Mentor) NOVAK, URBAN (Komentor) proteinsekundarna strukturakonkanavalin Aagregacijainfrardeča spektroskopijadiferenčna spektroskopijahomotavrinresveratrolPreučevali smo agregacijo konkanavalina A z uporabo infrardeče spektroskopije. Konkanavalin A je protein s pretežno sekundarno strukturo beta, ki ima zelo zanimivo vrsto agregacije. V kislem mediju se z nespremenjeno strukturo agregira v amorfne agregate, medtem ko v bazičnem okolju tvori amiloidne fibrile. Zato smo ga uporabili za testiranje zaviranja tvorbe amiloidov, ki so glavni povzročitelji tako imenovanih konformacijskih bolezni, kot sta npr. Parkinsonova in Alzheimerjeva bolezen. Tvorbo agregatov in amiloidov smo pospešili z dvigovanjem temperature. Za zaviranje smo uporabili dva znana zaviralca urejenih proteinskih agregatov, homotavrin in resveratrol. Izračunali smo sigmoidne krivulje ter določili in spremljali temperature prehoda iz raztopine v agregate, z in brez inhibitorja. Z metodo diferenčne spektroskopije smo spremljali majhne strukturne spremembe, ki nastanejo kot posledica zunanjih sprememb. Analizni spekter je izračunan kot razlika med dvema posnetima spektroma ob na primer različnih temperaturah. Zato nam ponuja metoda vpogled le v vrhove, ki niso skupni obema izhodnima spektroma. Temperatura prehoda ni naraščala, tako kot smo to pričakovali z naraščanjem koncentracije inhibitorja. Kjer se izkaže, da se je dvigovala, to ovržemo z negotovostjo meritev. Možnih razlogov za to je več, kriva je lahko napačna izbira koncentracijskih razmerij, nasičena raztopina, ali pa moja napaka pri mešanju raztopin. Največ težav pri raztapljanju smo imeli pri resveratrolu, zato mogoče ni bil najboljša izbira za izbrana koncentracijska razmerja.20202020-09-18 08:15:09Zaključna naloga120307sl