Analiza uporabe hiperelipsoidov pri ocenjevanju robustnosti biološkega procesorjaNastran, Jurij (Avtor) Moškon, Miha (Mentor) Pušnik, Žiga (Komentor) analiza robustnostivzorčenje Monte Carlohiperkvaderhiperelipsoidvolumensintezna biologijamodeliranjesimulacijaV okviru diplomske naloge predstavimo postopek analize robusnosti modelov sintetičnih bioloških gradnikov. Postopek analize demonstiramo na primeru modela biološkega procesorja. Robustnost ocenimo na podlagi volumna prostora dopustnih parametrov v visokodimenzionalnem prostoru. Ta volumen izračunamo z uporabo genetskih algoritmov, metode glavnih komponent, nazadnje pa z metodo Monte Carlo. V diplomski nalogi demonstriramo pomembnost učinkovitega reduciranja omejujočega prostora možnih Monte Carlo vzorčenj za pridobitev natančnejšega rezultata z manj ponovitvami. Namesto hiperkvadra predlagamo uporabo hiperelipsoidov. Implementiramo metodo naključnega enakomernega vzorčenja znotraj danega hiperelipsoida. Primerjamo tudi dva pristopa za računanje omejujočega hiperelipsoida s čim manjšim volumnom. Z uporabo teh metod demonstriramo prednosti in slabosti uporabe hiperelipsoidov kot alternativi hiperkvadra pri izbiri omejujočih teles. Pri nekaterih množicah dopustnih parametrov vodi manjši volumen omejujočega hiperelipsoida k redukciji potrebnih vzorčenj Monte Carlo za več kot magnitudo.20202020-09-15 12:30:01Diplomsko delo/naloga120063sl