Uporaba metagenomskih pristopov pri odkrivanju sekundarnih metabolitov mikrobnega izvoraLavrih, Ernestina (Avtor) Petković, Hrvoje (Mentor) biotehnologijametagenomska analizasekundarni metabolitiVelika večina sodobnih zdravil je bila razvita posredno ali pa neposredno iz naravnih biološko aktivnih učinkovin mikrobnega izvora. Kljub temu zaradi omejitev pri tradicionalni izolaciji in kultivaciji trčimo ob oviro; ocenjujemo, da velika večina od potencialno 1011-1012 mikrobnih vrst še vedno ne znamo gojiti v laboratorijskem okolju. Hkrati so antibiotiki, pridobljeni iz mikrobnih virov, postali manj uporabni, saj je njihova intenzivna uporaba terjala pojav patogenih mikroorganizmov, od katerih nekateri kažejo odpornost na praktično vse razrede antibiotikov. Odpornost na antibiotike hitro narašča, ob enem pa se število novo odkritih in strukturno učinkovin bistveno zmanjšuje. Danes ugotavljamo, da metagenomika za odkrivanje novih sekundarnih metabolitov postaja zelo obetavno orodje ravno zato, ker se opira na simultano sekvenciranje številnih genomov mikroorganizmov iz okolja, ki so potencialni vir novih biološko aktivnih učinkovin. Omogoča odkrivanje genov in razodevanje celotnih biosinteznih poti tako kultivabilnih kot nekultivabilhnih mikroorganizmov. Razvoj funkcionalne metagenomike in tiste, ki temelji na sekvenciranju, utira pot odkrivanju novih genskih skupin za pridobivanje biološko aktivnih učinkovin z biotehnološko zanimivi aplikacijami. Pojav sekvenciranja naslednje generacije in napredek bioinformatskih orodij sta prestopila nekaj ovir pri odkrivanju novih sekundarnih metabolitov. V diplomskem delu je povzeta zgodovina metagenomike, metagenomska analiza in nasploh metagenomski pristopi. V drugem pa je povzeta uporaba metagenmskih pristopov v odkrivanju novih sekundarnih metabolitov mikrobnega izvora.[E. Lavrih]20202020-07-23 07:15:40Diplomsko delo/naloga117714sl