Izvor in funkcije krožnih RNA in načini njihove detekcijeMolk, Neža (Avtor) Jakše, Jernej (Mentor) nekodirajoče RNAkrožne RNAmiRNA spužvefunkcije krožnih RNAidentifikacija krožnih RNAKrožne RNA so do nedavnega obravnavali kot stranske napake ali produkte transkripcije. Zanimanje zanje je narastlo z odkritjem njihovega celično specifičnega izražanja v več organizmih. V zadnjih letih so študije dokazale, da so krožne RNA dolge nekodirajoče, endogene, enoverižne molekule, ki so zaprte v kovalentni krog in niso poliadenilirane. V evkariontskih organizmih po zgradbi in nastanku krožne RNA delimo v 3 skupine. To so eksonske, intronske in eksonsko-intronske circRNA. Najbolj raziskan način njihovega nastanka je proces backsplicinga, ki ga regulirajo cis in trans delujoči elementi. Velik vpliv na njihovo izražanje imajo obratne komplementarne sekvence v obdajajočih intronih, ki se povežejo in spodbudijo njihov nastanek. S svojim delovanjem circRNA vplivajo na celično proliferacijo, celični cikel, pluripotentnost in diferenciacijo celic, staranje ter razvoj nekaterih bolezni. Njihov najbolj poznan način delovanja je regulacija izražanja protein kodirajočih genov preko vezave na miRNA. Razlog za njihovo pozno odkritje je morda prav njihova struktura, saj se večina detekcijskih metod osredotoča na zaznavanje poliadeniliranih RNA. Najpogostejši metodi za biokemijsko karakterizacijo circRNA sta kvantitativni RT-PCR in Northern prenos v kombinaciji z encimoma RNAaza R in RNaza H. V porastu pa je razvoj metod, ki temeljijo na bioinformatiki in statistiki in napovedujejo in zaznavajo circRNA iz naborov podatkov RNA-seq.[N. Molk]20202020-07-05 07:16:02Diplomsko delo/naloga117310sl