Diverziteta in interakcije mikrobiote kriosferePerini, Laura (Avtor) Gunde Cimerman, Nina (Mentor) Gostinčar, Cene (Komentor) ArktikaSvalbardGrenlandski ledeni pokrovglivebakterijeabundancapestrostNGSkulturomikaprihrofilne kvasovkeprotimikrobna odpornosthemolitična aktivnostmikrobne interakcijeledeniške algeDa bi izboljšali razumevanje mikrobiologije hitro izginjajočih arktičnih ledenikov, smo vzorčili ledeniška okolja na območjih, ki veljata za žarišče polarnih mikrobioloških raziskav, na Svalbardu in Grenlandiji. V vzorcih površinskega in podledeniškega ledu, kriokonitov, snega, ledeniške vode in vode na površini ledenikov smo analizirali mikrobno raznolikost in zastopanost s kombinacijo metod gojenja in molekularnih metod. Z gojenjem smo osamili okrog 500 čistih kultur gliv, ki so pripadale 77 vrstam (62 rodovom) in več kot 200 bakterijskih kultur, ki smo jih uvrstili v 27 vrst (23 rodov). Najpogosteje osamljeni bakterijski rodovi, skupni vzorcem tako Grenlandije kot Svalbarda, so bili Cryobacterium, Massilia, Pseudomonas in Sphingomonas. Pri glivah so bili skupni rodovi psihrofilnih bazidiomicetnih kvasovk Mrakia, Phenoliferia, Callizyma ter psihrotolerantni filamentozni Penicillium in Cladosporium. Callizyma je nov rod, izoliran z Grenlandije in Svalbarda, ki obsega dve novi oligotrofni in psihrofilni vrsti Callizyma psychrophila in Callizyma arctica. Sekvenciranje pomnožkov taksonomskih označevalcev je odkrilo večjo glivno raznolikost ledeniških habitatov v primerjavi s kulturomiko, vključno z nekaterimi nepričakovanimi najdbami, kot sta bili prisotnost dermatofitske glive Malassezia restricta in izjemno halotolerantne črne kvasovke Hortaea werneckii. Poleg tega smo s pomočjo sekvenciranja v vseh vzorcih odkrili prisotnost zgodnjih filogenetskih skupin gliv (Chytridiomycota in Rozellomycota). Tako v ledu baze ledenikov na Svalbardu, kot v površinskem ledu ledenikov na Grenlandiji, so večino gliv predstavljale bazidiomicete (večinoma iz razreda Microbotryomyecets). Najpogostejša bakterijska debla, ki smo jih odkrili s sekvenciranjem, so bile Proteobacteria, Cyanobacteria, Chroloflexi, Armatimonadetes, Actinobacteria in Bacteroidetes. Z iskanjem lastnosti, ki so običajno povezane s patogenostjo za človeka, smo med okoljskimi arktičnimi glivami in bakterijami našli več termotolerantnih in hemolitičnih sevov, ki so bili pogosto odporni tudi proti antimikotikom ali antibiotikom. Interakcije med izbranimi vrstami gliv in ledeniškimi algami, ki s cvetenjem v površinskem ledu grenlandskega ledenega pokrova pospešujejo taljenje ledu, so nakazale ugoden in ne škodljiv vpliv gliv v začetku sezone taljenja ledu, z možnim prehodom v bolj saprofitsko obliko rasti, ko se kasneje v sezoni stanje alge začne slabšati. Iste vrste gliv so proizvajale protimikrobne spojine, ativne proti preizkušenim klinično pomembnim in okoljskim bakterijskim vrstam, kar kaže na njihovo sposobnost modulacije rasti drugih mikroorganizmov.20202020-04-09 07:15:05Doktorsko delo/naloga115050sl