Pregled in primerjava računskih pristopov za analizo ritmičnega izražanja genovMiškić, David (Avtor) Moškon, Miha (Mentor) modeliranjeračunska biologijasistemska biologijaregresijacirkadiani ritmiPri modeliranju bioloških procesov pogosto naletimo na vzorce, ki se težko opišejo z obstoječimi metodami modeliranja in napovedovanja. To še posebno velja za analizo ritmičnega izražanja, saj se mora metoda spopasti z variacijami amplitud, period, faznih zamikov ter manjšim vzorcem, ki je pogosto onesnažen s človeškimi napakami. Zato je pomembno vedeti, kako se obnesejo obstoječe metode za take primere, in katere med njimi so bolj primerne in katere manj. Delo se posveča pregledu nekaterih obstoječih metod in optimalnemu izboru implementacij med obravnavanimi glede na doseženo točnost, ki jo dosežejo v petih serijah sintetično generiranih podatkov z različnimi parametri. S pomočjo rezultatov določimo, katere metode se obnesejo v katerih pogojih in kateri pogoji vzorčenja proizvedejo najbolj primerne podatke za analize. Na koncu izvedbo analize ritmičnosti naredimo še na primeru transkriptomskih podatkov, ki so bili pridobljeni iz javno dostopne podatkovne baze GEO.20202020-02-18 10:20:11Diplomsko delo/naloga114119sl