Sekundarne strukture DNA v topilih z različno dielektrično konstantoKrmpotić, Luka (Avtor) Plavec, Janez (Mentor) DNAdielektrična konstantaDMSOacetonitrilV celicah nastajajo brezmembranski organeli, ki predstavljajo ločeno tekočinsko fazo, sestavljeno iz proteinskih verig. Ta okolja so po dielektričnosti podobna organskim topilom, kot sta acetonitril in DMSO. V teh organelih se dvojna vijačnica DNA lahko razvije, strukture enoverižnih nukleinskih kislin pa se stabilizirajo. Z mešanicami topil acetonitril/voda in DMSO/voda smo posnemali dielektričnost okolja znotraj brezmembranskih organelov in opazovali vpliv na sekundarno strukturo DNA. Uporabili smo 17 baznih parov dolge komplementarne DNA verige. Z NMR spektroskopijo smo opazovali vpliv naraščajočega deleža organskih topil na vodikove vezi znotraj dvojne vijačnice DNA. Pokazali smo, da tako DMSO kot acetonitril destabilizirata dvojno vijačnico DNA. DMSO razvije dvojno vijačnico DNA pri nižjih volumskih deležih kot acetonitril. Pri 50% volumskem deležu DMSO v vodi komplementarni 17-merni verigi DNA še interagirajo, a niso več zvitev stabilno dvojno vijačnico. V 50% volumskem deležu acetonitrila v vodi se DNA še zvije v dvojno vijačnico, medtem ko pri 75% deležu ni več stabilnih interakcij med verigami. Pokazali smo, da so v mešanici DMSO/voda bazni pari G-C stabilnejši od baznih parov A-T. Destabilizacija strukture DNA ni povezana z dielektričnim koeficientom mešanic topil DMSO/voda ali acetonitril/voda, zato sklepamo, da ključno vlogo za stabilnost struktur v modelnem sistemu odigrajo drugi dejavniki.20192019-10-29 10:55:00Diplomsko delo/naloga112643sl