Proučevanje socialnih interakcij v populaciji bakterij Bacillus subtilis med divjim tipom in mutanto v genu amyEButolen, Lucija (Avtor) Dogša, Iztok (Mentor) populacija bakterijBacillus subtilissocialne interakcijerazgradnja škrobaV magistrski nalogi smo želeli vzpostaviti kompeticijski modelni sistem pri bakteriji Bacillus subtilis, kjer je divji tip producent zunajceličnega encima ?-amilaze, medtem ko sev z mutacijo v genu amyE encima ne proizvaja in v kokulturi z divjim tipom uporablja produkte ?-amilaze. Z gojenjem na gojišču s škrobom kot edinim virom ogljika smo ustvarili pogoje, kjer je produkcija encima ?-amilaze nujno potrebna za rast kulture. Raziskave interakcije smo se lotili na dva načina: v stresani kulturi in na trdnem gojišču. Iz poskusov s stresanimi, tekočimi kulturami smo želeli raziskati ali je strošek produkcije ?-amilaze zadosten. Ugotavljali smo ali pride do kolapsa populacije kokulture divjega tipa in mutante. Rezultati različnih poskusov nakazujejo na nizko metabolno ceno produkcijo ?-amilaze, zato ne opazimo razlik v razmerjih med sevi v kokulturah in v nobenem izmed poskusov ni prišlo do kolapsa kokulture po gojenju 100 generacij. Ker stresani pogoji niso pogosti v naravnih okoljih, smo se odločili socialno interakcijo preučiti tudi na trdnem gojišču. Ugotovili smo, da z daljšanjem medsebojne razdalje nacepitve med divjim tipom in sevom z mutacijo v genu amyE, divji tip pridobi prednost, zelo verjetno zaradi omejene difuzije in preferenčnega pridobivanja hranil. Zanimalo nas je tudi, kaj se zgodi s sevom z mutacijo v genu amyE, ko biofilm kokulture divjega tipa in mutante propade in se ustvari na svežem trdnem gojišču nov biofilm. Rezultati kažejo, da ima v novih biofilmih divji tip prednost pred mutanto, saj se ob precepitvi na sveže gojišče razdalja med divjim tipom in mutanto poveča in tako mutanta izgubi dostop do hranil.[L. Butolen]20192019-09-22 07:47:08Magistrsko delo/naloga111062sl