Optimizacija metod kolokalizacije za funkcionalno analizo genov krompirja, ki sodelujejo pri obrambnem odzivu na krompirjev virus YRace, Andrej (Avtor) Gruden, Kristina (Mentor) krompir-PVY interakcijakolokalizacijaSAPK8ERF98.2PP2CPVY predstavlja najbolj ekonomsko škodljiv virus za gojenje krompirja. Precej podatkov o mehanizmih interakcije med PVY in krompirjem je že poznanih, od interakcij različnih sevov PVY z različnim genotipi krompirja, do vpliva hormonov na imunski odgovor krompirja in vlog posameznih genov PVY ter krompirja v tej interakciji. Namen tega dela je bilo preverjanje interakcije med proteini imunskega odgovora krompirja s pomočjo metode kolokalizacije za interakcije, ki so bile potrjene kot pozitivne z metodo dvohibridnega sistema kvasovk. V eksperimentu smo najprej pripravili dva seva transgenih agrobakterij, od katerih je en vseboval binarni plazmid z zapisom za ERF98.2-GFP in drugi binarni plazmid z zapisom za PP2C-GFP. Agrobakterije smo nato uporabili za analizo lokalizacije SAPK8-RFP, ERF98.2-GFP in PP2C-GFP v listih N. benthamiana in preverili, ali pride do kolokalizacije SAPK8-RFP in ERF98.2-GFP ter SAPK8-RFP in PP2C-GFP. Rezultati so pokazali, da je do kolokalizacije SAPK8-RFP in ERF98.2-GFP prišlo v jedru in citoplazmi, medtem ko je do kolokalizacije SAPK8-RFP in ERF98.2-GFP prišlo le v jedru, čeprav v večini celic ni bila vidna.20192019-09-13 12:55:07Diplomsko delo/naloga110324sl