Genotipizacija bakterije Mycoplasma pneumoniae in ugotavljanje patogenosti posameznih genotipov in vitroKogoj, Rok (Avtor) Keše, Darja (Mentor) Mycoplasma pneumoniaeepidemiologijagenotipizacijapatogenezacitotoksičnostimunski odzivV raziskavi smo želeli ugotoviti pojavnost okužb dihal povzročenih z bakterijo M. pneumoniae pri slovenskih bolnikih v obdobju desetih let, spoznati kateri genotipi so bili v tem obdobju navzoči ter proučiti, če obstajajo med posameznimi genotipi razlike v patogenosti in vitro. Pregledali smo podatke iz strokovno zdravstvene dejavnosti za dokaz okužb z M. pneumoniae in jih analizirali. Shranjene izolate M. pneumoniae smo uporabili za genotipizacijo bakterije na podlagi gena za beljakovino P1 s pirosekvenciranjem in dodatno še z metodo MLVA. Pet genotipov smo uporabili za okužbo celic A549 in merili hitrost razmnoževanja mikoplazem, citotoksični učinek na gostiteljske celice ter tvorbo provnetnih citokinov IL-1β, IL-6, IL-8, TNF-α in IFN-γ. Ugotovili smo, da smo v obdobju med 2006 in 2015 v Sloveniji imeli dve epidemiji (2010/11 in 2014/15). V prvi epidemiji je prevladoval P1 tip 2, medtem ko v drugi P1 tip 1. Skupaj smo odkrili devet genotipov MLVA od katerih so bili trije (MLVA-3,5,6,2; MLVA-3,6,6,2 in MLVA-4,5,7,2) navzoči stalno in predstavljali 95,2 % vseh izolatov. Med petimi izbranimi genotipi MLVA nismo opazili razlik v hitrosti razmnoževanja ali citotoksičnosti. Celice so se na okužbo z vsemi testiranimi genotipi, razen MLVA-3,5,6,2, odzvale enako: z visoko tvorbo IL-6 in IL-8, manjšim porastom IL-1β ter brez odziva s TNF-α ali IFN-γ. Za genotip MLVA-3,5,6,2 smo opazili zavrto tvorbo IL-6 glede na negativno kontrolo ter statistično značilno manjšo tvorbo IL-8 glede na ostale genotipe. Vse skupaj nakazuje ne morebiten vpliv genetske različice bakterije na odziv gostiteljskih celic.20192019-06-23 07:15:04Doktorsko delo/naloga108265sl