Razvoj spletne aplikacije za zaznavanje variabilnosti v zaporedju DNAAVDIĆ, JASMIN (Avtor) Rožanc, Igor (Mentor) Gruden, Kristina (Komentor) BashDNADNA variacijePHPPythonporavnavanukleotidspletna aplikacijazaporedjeV diplomski nalogi je predstavljen postopek izdelave spletne aplikacije za zaznavanje variabilnosti v zaporedju DNA z imenom Amplicode 2018. DNA je dvoverižno zaporedje, ki je zgrajeno iz štirih nukleotidov: adenina (A), citozina (C), gvanina (G) in timina (T). Tako kot so organizmi različni med seboj navzven se ti razlikujejo tudi v genetskem zapisu. Različne variacije zaporedij v genu določajo različne lastnosti; npr. pri človeku višino, barvo las, oči, naklonjenost za različne bolezni, ... Spletna aplikacija Amplicode 2018 omogoča zaznavo takšnih variacij v izbranem genu z različnimi odprtokodnimi orodji. Celoten postopek izbire orodij in potrebnih nastavitev se odvija na uporabniku prijazni spletni strani. To lahko uporabljajo tudi manj izkušeni poznavalci operacijskega sistema Linux ter vseh ukazov in stikal, ki jih odprtokodna orodja ponujajo. Končni rezultat je vedno iste oblike, ne glede na različne vmesne korake, kar daje uporabniku možnost analize kakovsti zaznave variacij glede na različna orodja in pomaga pri odločitvah za nadaljnje wet lab korake.20182018-09-14 12:25:04Diplomsko delo/naloga103193sl