Molekularna in filogenetska opredelitev novih papilomavirusov osamljenih iz novotvorb ustne votline in anogenitalnega predela japonskih makakovSkubic, Lucijan (Avtor) Poljak, Mario (Mentor) papilomavirusjaponski makakinovotvorbe ustne votline in anogenitalnega predelamolekularna opredelitevfilogenetska opredelitevPapilomavirusi (PV) so raznolika skupina vrstno-značilnih, majhnih DNA virusov, ki so etiološko povezani z nastankom številnih benignih in malignih neoplastičnih sprememb kožnega ter sluzničnega epitela. Namen naše raziskave je bil opredeliti vsaj en nov genotip PV, ki povzroča okužbe pri japonskih makakih (Macaca fuscata), in ugotoviti ali je bil etiološko povezan z nastankom izhodiščnih novotvorb. V vzorcu benigne novotvorbe anogenitalnega predela japonskega makaka smo pomnožili celotni genom MfuPV2, določili njegovo nukleotidno zaporedje in ga skupaj z genomom MfuPV1, ki je bil osamljen iz vzorca maligne novotvorbe ustne votline japonskega makaka, molekularno in filogenetsko opredelili. Molekularna analiza je pokazala, da oba virusna genoma nosita zapis za beljakovine z ohranjenimi funkcionalnimi domenami in nekodirajoče področje z regulatornimi zaporedji, ki skupaj omogočajo, da lahko PV uspešno zaključita svoj življenjski krog ter okužita nove gostiteljske celice. MfuPV1 se skupaj z genotipi PV, ki so bili osamljeni iz anogenitalne sluznice javanskih in rezus makakov, uvršča v vrsto Alpha-12, medtem ko je genotip MfuPV2 najverjetneje predstavnik nove virusne vrste znotraj rodu Alphapapillomavirus. Na podlagi relativno visokih ocen virusnega bremena MfuPV1 in MfuPV2 sklepamo, da bi lahko bila oba novo-odkrita genotipa PV etiološko povezana z nastankom izhodiščnih novotvorb.20182018-09-14 07:47:49Magistrsko delo/naloga103168sl