Prevalenca borelij lymske borelioze v malih sesalcihCvetko, David (Avtor) Ružić Sabljić, Eva (Mentor) Cerar Kišek, Tjaša (Komentor) Borrelia burgdorferi sensu latoBorrelia miyamotoiprevalencamali sesalcilymska boreliozamolekularne metodekultivacijaMLSTMluILRFPV Sloveniji je lymska borelioza najpogostejša bolezen, katere povzročitelje prenašajo klopi. Povzročajo jo predstavniki kompleksa Borrelia burgdorferi sensu lato. Borelije za uspešno razmnoževanje potrebujejo kompetentne gostitelje. Pri nas so to mali sesalci, ptiči in kuščarji. Opravili smo epidemiološko raziskavo prekuženosti malih sesalcev z Borrelia burgdorferi sensu lato in Borrelia miyamotoi. Prisotnost borelij lymske borelioze smo preverili v srcih in pljučih testiranih živali. S PCR v realnem času smo dokazovali prisotnost gena ospA v vzorcih. Odkrili smo, da je okuženih 20,25 % malih sesalcev. Manjšo diagnostično občutljivost je pokazala metoda kultivacije, s katero smo odkrili prisotnost B. burgdorferi sensu lato pri 6,01 % malih sesalcev. Pričakovano je bila prevalenca B. miyamotoi mnogo manjša. Z molekularnimi metodami in sekvenciranjem smo pri malih sesalcih odkrili 0,61 % prevalenco B. miyamotoi. Želeli smo natančneje identificirati osamljene borelije lymske borelioze, zato smo izolirane seve genotipizirali z metodo polimorfizma dolžin restrikcijskih fragmentov celotnega genoma (angl. large restriction fragment pattern, MluI-LRFP) in metodo tipizacije na osnovi multilokusnih zaporedji (angl. multilocus sequence typing, MLST). Z metodo MluI-LRFP smo ugotovili, da vsi izolirani sevi borelij lymske borelioze pripadajo podtipu Mla1 vrste Borrelia afzelii. Boljšo sposobnost ločevanja znotraj vrste omogoča MLST. Z MLST smo odkrili tri različne sekvenčne tipe. Vsi trije sekvenčni tipi pripadajo B. afzelii in so že bili odkriti v Sloveniji. Naše ugotovitve potrjujejo uspešno razmnoževanje in kroženje borelij med gostitelji, prenašalci in ljudmi.[D. Cvetko]20182018-09-08 07:45:02Magistrsko delo/naloga102769sl