Vpliv mešanih okužb virusa Y krompirja in virusa mozaika pepina na količino virusov in bolezenske znake v različnih gostiteljskih rastlinahKogej, Zala (Avtor) Ravnikar, Maja (Mentor) Kutnjak, Denis (Komentor) rastlinski virusivirus Y krompirjavirus mozaika pepinamešana okužbabolezenska znamenjasinergizemmehansko okuževanjemolekulske metodeRT-qPCRfluorimetrijaMešane okužbe rastlin z virusi so pogoste tako v naravi kot v gojenih rastlinah. Zanimal nas je odnos med pri nas razširjenim virusom Y krompirja (PVY) in virusom mozaika pepina (PepMV), ki se v zadnjem času hitro širi po Evropi, v Sloveniji pa še ni prisoten. Virusa imata podoben nabor gostiteljev in teoretično lahko okužita isto rastlino. Ker se vplivi mešanih okužb razlikujejo med gostitelji, smo izbrali 3 vrste testnih rastlin: krompir (Solanum tuberosum), paradižnik (Solanum lycopersicum) in vrsto tobaka Nicotiana benthamiana. Na različnih sortah krompirja smo rastline inokulirali na 3 različne načine (samo s PVY, samo s PepMV in z obema), da bi ugotovili, če izbrane sorte sploh lahko okužimo s PepMV. Pri paradižniku in tobaku smo vzpostavili 8 različnih načinov inokulacije, saj nas je zanimalo ali na uspešnost okužbe in bolezenska znamenja vpliva tudi časovni potek inokulacije. 4 tedne po mehanski inokulaciji smo popisali bolezenska znamenja, ki so se med vrstami razlikovala, in izolirali celokupno RNA iz izbranih vzorcev. Količino virusa v teh vzorcih smo določili s pomočjo kvantiativne verižne reakcije s polimerazo, pri čemer smo v raziskavo vključili tudi primerjavo normalizacij s pomočjo referenčnega gena COX in količino celokupne RNA ter ugotovili, da sta zelo primerljivi. Nobene od 6 sort krompirja nismo uspeli okužiti s PepMV. Paradižnik in tobak sta se okužila ne glede na to ali je bila inokulacija sočasna ali zaporedna. V nekaterih primerih smo pri mešanih okužbah zaznali mnogo močnejša bolezenska znamenja. Med nekaterimi načini inokulacije smo opazili razlike v količini virusov.20182018-07-28 07:45:07Magistrsko delo/naloga102256sl