Analiza genetske variabilnosti s hipoksijo induciranih transkripcijskih dejavnikov alfa pri družinski eritrocitozi.Kristan, Aleša (Avtor) Debeljak, Nataša (Mentor) Kunej, Tanja (Komentor) genetska variabilnosts hipoksijo inducirani transkripcijski faktorHIFAEPAS1družinska eritrocitozarazličica nukleotidnega zaporedjaDružinska eritrocitoza je redka, prirojena bolezen s heterogenim genetskim ozadjem, opredeljena s povišanim številom eritrocitov ter povečanim hematokritom in hemoglobinom v krvi. S hipoksijo inducirani transkripcijski dejavniki alfa (HIFA) vplivajo na povišanje števila eritrocitov z aktivacijo prepisovanja tarčnih genov pri nizkih koncentracijah kisika. Različice nukleotidnega zaporedja v genu za eno izmed treh izoform HIFA, za endotelijsko PAS domeno 1 (EPAS1), vodijo do razvoja družinske eritrocitoze tipa 4. Z raziskavo smo ob sodelovanju s Specializiranim hematološkim laboratorijem Kliničnega oddelka za hematologijo Univerzitetnega kliničnega centra (UKC) Ljubljana postavili diagnostični test za identifikacijo različic, povezanih z družinsko eritrocitozo, v nukleotidnem zaporedju gena EPAS1. Pri tem smo optimizirali reakcijo PCR za pomnoževanje treh izbranih regij gena EPAS1 ter z metodo po Sangerju določili zaporedje izbranih regij v skupni velikosti 1374 baznih parov. Z novo razvito diagnostično metodo smo analizirali vzorce štirih bolnikov iz treh družin in dveh zdravih preiskovancev kontrolne skupine. Rezultati so pokazali, da so vsi bolniki homozigoti (GG) na mestu različice nukleotidnega zaporedja c.C1035-7G (rs7557402) in trije bolniki homozigoti (TT) na mestu različice nukleotidnega zaporedja c.C1249+151T (rs11678817). Na obeh lokusih je bil sorodni preiskovanec kontrolne skupine heterozigot, medtem ko je bil nesorodni preiskovanec kontrolne skupine homozigot (CC). Za ovrednotenje pomena identificiranih različic nukleotidnega zaporedja pri nastanku eritrocitoze so potrebne nadaljnje raziskave.[A. Kristan]20182018-04-08 07:45:02Magistrsko delo/naloga100707sl