Podrobno

Vpliv različic EPAS1 na izražanje tarčnih genov transkripcijskih dejavnikov HIF
ID Matov, Matea (Avtor), ID Debeljak, Nataša (Mentor) Več o mentorju... Povezava se odpre v novem oknu

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (3,26 MB)
MD5: D92ED21ECFFD1BAAF9683D7FCBD90E30

Izvleček
Eritrocitoza je bolezensko stanje, za katero je značilno povečano število eritrocitov in povišane vrednosti hemoglobina. Eden od vzrokov za družinsko eritrocitozo so genetske različice v genu EPAS1 oz. ob hipoksiji inducirani transkripcijski dejavnik HIF2A, ki sodeluje pri uravnavanju eritropoeze. Namen magistrskega dela je bil raziskati funkcionalni vpliv različice EPAS1 (NM_001430.5) c.2120A>C (p.Lys707Thr), ki je opredeljena kot različica z nejasnim pomenom (VUS), ter jo primerjati s patogeno različico EPAS1 (NM_001430.5) c.1609G>A (p.Gly537Arg,) in divjim tipom. Vpliv na transkripcijsko aktivnost smo analizirali z luciferaznim reporterskim testom, vpliv na sintezo proteina EPAS1 z metodo prenosa po westernu ter vpliv na stabilnost proteina s cikloheksamidnim testom. Oba testa smo izvedli v celični liniji HEK293. Rezultati so pokazali povečano transkripcijsko aktivnost na hipoksijo odzivnega elementa (ang. hypoxia responsive element, HRE) v primerjavi z divjim tipom. Obe različici, p.Gly537Arg in p.Lys707Thr, sta v primerjavi z divjim tipom izkazovali nižjo stabilnost proteina EPAS1, kljub višjemu izražanju. Naši rezultati nakazujejo, da lahko različica p.Lys707Thr vpliva na povečano funkcijo proteina EPAS1, kar nakazuje na motnjo v procesa lokalizacije v jedru, kar bi lahko prispevalo k razvoju eritrocitoze. Za dokončno opredelitev patogenosti so potrebne nadaljnje funkcionalne študije.

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:družinska eritrocitoza, gen EPAS1, različica gena, luciferazni reporterski test, stabilnost proteina
Vrsta gradiva:Magistrsko delo/naloga
Tipologija:2.09 - Magistrsko delo
Organizacija:BF - Biotehniška fakulteta
Leto izida:2026
PID:20.500.12556/RUL-185501 Povezava se odpre v novem oknu
COBISS.SI-ID:287617795 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:07.08.2026
Število ogledov:131
Število prenosov:48
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Effect of EPAS1 variants on expression of HIF target genes
Izvleček:
Erythrocytosis is a clinical condition characterized by an increased red blood cell count and elevated hemoglobin levels. One of the causes of familial erythrocytosis is genetic variants in the EPAS1 gene, also known as hypoxia-inducible transcription factor 2-alpha (HIF2A), which is involved in the regulation of erythropoiesis. The aim of this master's thesis was to investigate the functional impact of the EPAS1 variant (NM_001430.5) c.2120A>C (p.Lys707Thr), currently classified as a variant of uncertain significance (VUS), and compare it with the pathogenic EPAS1 variant (NM_001430.5) c.1609G>A (p.Gly537Arg) and the wild type. The impact on transcriptional activity was analyzed using a luciferase reporter assay, the effect on EPAS1 protein synthesis was analyzed using western blot, while the effect on protein stability was assessed using a cycloheximide assay. Both assays were performed in the HEK293 cell line. The results demonstrated increased transcriptional activity of the hypoxia response element (HRE) promoter for both variants compared to the wild type. Furthermore, both the p.Gly537Arg and p.Lys707Thr variants exhibited lower stability of the EPAS1 protein relative to the wild type, despite higher expression. Our findings suggest that the p.Lys707Thr variant may enhance EPAS1 protein function, potentially through the disruption of the nuclear localization process, thereby contributing to the development of erythrocytosis. Further functional studies are required to definitively establish its pathogenicity.

Ključne besede:familial erythrocytosis, EPAS1 gene, gene variant, luciferase reporter assay, protein stability

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj