Mikro RNA kot diagnostični označevalci granulomatoze s poliangiitisom v biopsijah sinonazalne sluznice

Živanović, Milanka (avtor), Volavšek, Metka (mentor), Hočevar, Alojzija (komentor)

Granulomatoza s poliangiitisom (GPA) je redka avtoimunska bolezen, ki jo uvrščamo med vaskulitise, katerih patogeneza je povezana s prisotnostjo protiteles proti sestavnim delom citoplazme nevtrofilnih granulocitov (ANCA). GPA pogosto prizadene zgornja dihala, zlasti sinonazalno sluznico. Biopsija sinonazalne sluznice lahko pomembno prispeva k diagnozi GPA, vendar so v biopsiha pogosto prisotne le neznačilne vnetne spremembe, za GPA značilne histološke spremembe pogosto niso prisotne, zato je zgodnja prepoznava bolezni pogosto otežena. Epigenetika, zlasti izražanje mikro RNA (miRNA), igra ključno vlogo v patogenezi avtoimunskih sistemskih bolezni, miRNA izkazujejo potencial kot biološki označevalci za to skupino bolezni. V naši raziskavi smo analizirali izražanje miRNA v sino-nazalnih biopsijah bolnikov z GPA in preverili, v kolikšni meri izražanje miRNA v biopsijskih vzorcih pripomore k zgodnejši prepoznavi bolezni. V raziskavo smo vključili 37 biopsijskih tkivnih vzorcev sinonazalne sluznice bolnikov z GPA, 15 vzorcev sinonazalne sluznice bolnikov z vnetjem druge etiologije ter 14 vzorcev preiskovancev brez histoloških sprememb v sinonazalni sluznici, ki so služili kot kontrolna skupina. Ocena histoloških parametrov je bila izvedena z uporabo histoloških tehnik, analiza izražanja miRNA pa z uporabo komercialnega kompleta miRCURY LNA miRNA miRNome Human PCR Panel I+II in kvantitativno PCR v realnem času (qPCR). Od vključenih bolnikov z GPA je imelo 20 bolnikov za GPA značilno histološko sliko, 17 bolnikov pa za GPA nespecifične histopatološke spremembe. S profiliranjem izražanja miRNA v tkivnih vzorcih sinonazalne sluznice smo določili izražanje 306 miRNA, z razlikami v nivoju izražanja med posameznimi podskupinami bolnikov in preiskovancev. Na osnovi rezultatov profiliranja izražanja miRNA smo za nadaljnjo validacijo izražanja na posameznih vzorcih s qPCR izbrali 11 miRNA (miR-1-3p, miR-31-3p, miR-155-5p, miR-183-5p, miR-21-3p, miR-106a-5p, miR-190b-5p, miR-1248, let-7b-5p, miR-93-5p in miR-182-5p), katerih profili izražanja so omogočali statistično značilno razlikovanje med vključenimi skupinami bolnikov in preiskovancev. Z našo raziskavo smo določili vzorce izražanja različnih miRNA, povezanih z diagnozo GPA, ki so bile v korelaciji s kliničnimi in histološkimi parametri bolnikov. Te miRNA predstavljajo obetavne diagnostične biološke označevalce, ki bi lahko prispevali k zgodnejši in zanesljivejši diagnozi GPA v tkivu sinonazalne sluznice, zlasti pri oceni bolnikov v naj-zgodnejših fazah GPA ali tistih z atipično klinično in/ali histološko sliko.

• Jezik: Slovenski jezik
• Ključne besede: granulomatoza s poliangiitisom, sinonazalna sluznica, vnetje, mikro RNA, biološki označevalci
• Vrsta gradiva: Doktorsko delo/naloga
• Organizacija: MF - Medicinska fakulteta
• Leto izida: 2025
• PID: 20.500.12556/RUL-176033
• Datum objave v RUL: 19.11.2025

Sekundarni jezik

• Jezik: Angleški jezik
• Naslov: MicroRNA as diagnostic biomarker of granulomatosis with polyangiitis in biopsies of sinonasal mucosa

Izvleček

Granulomatosis with polyangiitis (GPA) is a rare autoimmune disease belonging to vasculitides that are pathogenetically related to anti-neutrophil cytoplasmic antibodies (ANCA). GPA often manifests in the upper respiratory tract, particularly in the sinonasal mucosa. Sinonasal biopsies can contribute significantly to correct diagnosis of GPA. However, biopsies frequently lack characteristic histological features and exhibit only nonspecific inflammation complicating early diagnosis of GPA. Epigenetic mechanisms, particularly microRNAs (miRNAs) have been increasingly implicated in the pathogenesis of autoimmune diseases and miRNAs seem promising as biomarkers for autoimmune diseases including GPA. In our study, we analyzed miRNA expression in sinonasal biopsy samples of patients with GPA and investigated if miRNA expression in sinonasal biopsies can contribute to early diagnosis of GPA. The study included 37 sinonasal biopsy tissue samples from patients with GPA, 15 samples of sinonasal mucosa from patients with inflammation of other etiology, and 14 samples of sinonasal mucosa from control patient group without significant histopathological changes in the sinonasal mucosa. Among the GPA patients, 20 exibited histopathological features characteristic of GPA, while 17 had non-specific histological findings. Histological assesment was performed using standard histopathological techniques, while miRNA expression analysis was conducted using a miRCURY LNA miRNA miRNOME Human PCR Panel I+II and quantitative real-time PCR (qPCR). Through miRNA expession profiling in sinonasal mucosal tissue samples, we identified 306 miRNAs that showed differential expression patterns between individual patient subgroups. Based on these results, we selected 11 miRNAs (miR-1-3p, miR-31-3p, miR-155-5p, miR-183-5p, miR-21-3p, miR-106a-5p, miR-190b-5p, miR-1248, let-7b-5p, miR-93-5p, and miR-182-5p) for further validation using qPCR, as expression profiles of these miRNAs demonstrated statistically significant differences among the analyzed patient groups. Our study identified distinct miRNA expression patterns associated with GPA, which correlated with clinical and histopathological parameters, established in the study. Identified miRNAs represent promising diagnostic biomarkers that may improve the accuracy and early diagnosis of GPA in sinonasal mucosal tissues, particularly in patients in the early stages of the disease or those presenting with atypical clinical and/or histological features.

• Ključne besede: granulomatosis with polyangiitis, sinonasal tissue, inflammation, microRNA, biomarkers