Podrobno

Validacija hkratnega PCR v realnem času za dokaz toksigenosti bakterije Klebsiella oxytoca v čistih kulturah in kužninah
ID Dmitrovikj Stefanovska, Tamara (Avtor), ID Pirš, Mateja (Mentor) Več o mentorju... Povezava se odpre v novem oknu, ID Strašek Smrdel, Katja (Komentor), ID Maver Vodičar, Polona (Recenzent)

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (6,98 MB)
MD5: 25A94304EBD27EF0034037B90233DB2D

Izvleček
Driska je pogosta prebavna motnja, ki se kaže s pogostim odvajanjem tekočega blata (vsaj trikrat dnevno) in spremljajočimi simptomi, kot so trebušni krči, napihnjenost in slabost. Posebej pomembna je driska, povezana z antibiotiki (DPA), ki se pojavi pri 5–35 % bolnikov na antibiotični terapiji. Med pomembnejšimi povzročitelji je Klebsiella oxytoca, ki lahko ob prekomerni razrasti proizvaja toksina tilivalin in tilimicin. Ta lahko povzročita hud z antibiotičnim zdravljenjem povezan hemoragični kolitis (angl. antibiotic-associated hemorrhagic colitis AAHC) – vnetje debelega črevesa s krvavo drisko, zlasti ob zdravljenju z β-laktamskimi antibiotiki, kot je penicilin. K. oxytoca je sicer lahko normalno prisotna v črevesju, a lahko postane problematična ob porušenju ravnovesja mikrobiote zaradi antibiotikov. V raziskavi smo uporabili metodo hkratnega PCR v realnem času z namenom ugotavljanja toksigenosti bakterije K. oxytoca v čistih kulturah in kužninah. Pridobljeni rezultati kažejo, da se je molekularna metoda dobro izkazala za hitro in natančno detekcijo bakterije K. oxytoca in določanje njene toksigenosti s pomočjo hkratne detekcije vseh treh ključnih virulenčnih genov AAHC: pehX, npsA, npsB. V okviru magistrske naloge smo analizirali 208 vzorcev, med katerimi smo bakterijo K. oxytoca zaznali v 150 primerih, kar predstavlja 72,12 % vseh testiranih vzorcev. Analiza je pokazala, da je bila toksigena K. oxytoca, povzročiteljica hemoragičnega kolitisa, prisotna v 91 primerih, kar predstavlja 60,67 % vseh pozitivnih vzorcev. Netoksigeni sev bakterije smo zaznali v 59 primerih, kar predstavlja 39,33 %.

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:Klebsiella oxytoca, driska povezana z antibiotiki, verižna reakcija s polimerazo v realnem času, z antibiotičnim zdravljenjem povezan hemoragični kolitis
Vrsta gradiva:Magistrsko delo/naloga
Tipologija:2.09 - Magistrsko delo
Organizacija:BF - Biotehniška fakulteta
Založnik:[T. Dmitrovikj Stefanovska]
Leto izida:2025
PID:20.500.12556/RUL-175074 Povezava se odpre v novem oknu
UDK:579.61:616.3-078
COBISS.SI-ID:253233667 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:15.10.2025
Število ogledov:149
Število prenosov:32
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Validation of real-time PCR for detection of toxigenic Klebsiella oxytoca from bacterial culture and clinical samples
Izvleček:
Diarrhea is a common gastrointestinal disorder characterized by frequent passage of loose stools (at least three times daily) and accompanying symptoms such as abdominal cramps, bloating, and nausea. Of particular importance is antibiotic-associated diarrhea (AAD), which occurs in 5-35 % of patients receiving antibiotic therapy. Among the significant causative agents is Klebsiella oxytoca, which produces the toxins tilivaline and tilimicin upon overgrowth. These toxins can cause severe antibiotic-associated hemorrhagic colitis (AAHC) – inflammation of the colon with bloody diarrhea, particularly during treatment with β-lactam antibiotics such as penicillin. K. oxytoca is normally present in the intestine but becomes problematic when the microbiota balance is disrupted by antibiotics. In this study, we employed simultaneous real-time PCR methodology to determine the toxigenicity of K. oxytoca bacteria in pure cultures and clinical specimens. The obtained results demonstrate that the molecular method performed well for rapid and accurate detection of bacteria K. oxytoca and determination of its toxigenicity through simultaneous detection of all three key AAHC virulence genes: pehX, npsA, and npsB. In the scope of our master's thesis, we analyzed 208 samples, in which the bacteria K. oxytoca was detected in 150 cases, representing 72,12% of all tested samples. The analysis showed that toxigenic K. oxytoca, a causative agent of hemorrhagic colitis, was present in 91 cases, which represents 60,67% of all positive samples. The non-toxigenic strain of the bacterium was detected in 59 cases, representing 39,33%.

Ključne besede:Klebsiella oxytoca, antibiotic-associated diarrhea, real time -polymerase chain reaction, antibiotic-associated hemorragic colitis

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj