Herpesvirusi pri izbranih skupinah prostoživečih ptic

Žlabravec, Zoran (avtor), Račnik, Joško (mentor), Vrezec, Al (komentor)

Ptice so gostitelji številnih herpesvirusov (HV). Okužba pri njih lahko ostane neopažena ali povzroči (letalno) bolezen. Za razliko od HV pri perutnini so podatki o okužbi, prisotnosti in vplivu HV na prostoživeče ptice skopi. Celotni seznam naravnih gostiteljev HV pri pticah ni poznan. Vzorce organov, orofaringealnih in/ali kloakalnih brisov 1212 živih in mrtvih prostoživečih ptic iz 15 redov smo pregledali na prisotnost odseka gena DNA polimeraze HV. HV smo dokazali v vzorcih organov osmih od 55 (14,5 %) pregledanih poginjenih sov, v brisih kloake štirih od 525 (0,7 %) pregledanih prostoživečih pevk, odlovljenih med jesensko selitvijo, v orofaringealnih in/ali kloakalnih brisih 34 od 447 (7,5 %) prostoživečih bolnih, poškodovanih ali oslabelih ptic, ki so potrebovale nujno veterinarsko pomoč in so bile sprejete na Kliniko za ptice, male sesalce in plazilce Veterinarske fakultete, in v orofaringealnih brisih 16 od 170 (9,4 %) živih prostoživečih sov, vzorčenih na območju Krima in Jelovice. HV smo odkrili tako pri poginjenih kot tudi pri živih, klinično zdravih prostoživečih pticah. V gnezdeči populaciji sov nismo ugotovili vpliva HV na produktivnost sov, saj se število jajc in mladičev med okuženimi in neokuženimi gnezdi ni razlikovalo. Filogenetska analiza nukleotidnih zaporedij odseka gena DNA polimeraze HV je pokazala, da se HV, dokazani pri prostoživečih pticah, uvrščajo v poddružino Alphaherpesvirinae in da v populaciji prostoživečih ptic v Sloveniji krožijo različni HV, ki se v večini primerov razlikujejo od že znanih HV, objavljenih v genski banki. Nekateri HV so specifični za gostiteljsko vrsto ptic, medtem ko smo v nekaterih primerih v različnih redovih ptic odkrili zelo podobna oziroma identična nukleotidna zaporedja, kar pomeni, da HV niso vedno omejeni na vrsto ptice. Do prenosa HV bi lahko prišlo s plenjenjem ptičjega plena ali celo s superplenilstvom. Ugotovili smo tudi, da mali glodavci kot plen ne predstavljajo vira okužbe s HV za ptice iz reda sov, sokolov in ujed. Z opravljenimi študijami smo močno razširili seznam dovzetnih gostiteljskih vrst prostoživečih ptic in ugotovili, da je za dokaz HV pri prostoživečih pticah z neznanim statusom okužbe treba odvzeti tako brise orofarinksa kot brise kloake.

• Jezik: Slovenski jezik
• Ključne besede: bolezni ptic – virologija, Alphaherpesvirinae, herpesvirusne infekcije – diagnostika – genetika – klasifikacija, verižna reakcija s polimerazo – metoda, analiza zaporedja DNA, filogeneza, sove
• Vrsta gradiva: Doktorsko delo/naloga
• Organizacija: VF - Veterinarska fakulteta
• Leto izida: 2022
• PID: 20.500.12556/RUL-143968
• Datum objave v RUL: 25.01.2023

Sekundarni jezik

• Jezik: Angleški jezik
• Naslov: Herpesviruses in selected groups of free-living birds

Izvleček

Birds are hosts of many herpesviruses (HVs), in which the infection can go unnoticed or cause (lethal) disease. In contrast to HV in poultry, data on infection with and the presence and impact of HV in wild birds are limited. In birds, the full list of natural hosts of HV is unknown. Samples of organs and oropharyngeal and/or cloacal swabs of 1,212 live and dead free-living birds from 15 orders were examined for the presence of a fragment of the HV DNA polymerase gene. HV was detected in organ samples in eight out of 55 (14.5%) dead owls, in cloacal swabs in four out of 525 (0.7%) free-living songbirds caught during the autumn migration, in oropharyngeal and/or cloacal swabs in 34 out of 447 (7.5%) free-living birds admitted as wildlife casualties to the Clinic for Birds, Small Mammals, and Reptiles at the Faculty of Veterinary Medicine, and in oropharyngeal swabs in 16 out of 170 (9.4%) live free-living owls sampled on Mount Krim and the Jelovica Plateau. HVs were detected in individuals found dead as well as in live individuals with no clinical signs of illness. Furthermore, no productivity deviances (i.e., in clutch and brood size) were recorded in a breeding population of clinical healthy owls. Phylogenetic analysis of nucleotide sequences of the partial DNA polymerase gene of HVs showed that HVs detected in free-living birds belong to the subfamily Alphaherpesvirinae and that different HVs have been circulating in the population of free-living birds in Slovenia, which in most cases are different from known HV nucleotide sequences published in GenBank. Some HVs are specific to the host bird species, whereas in some cases HVs very similar to identical nucleotide sequences were found in different bird orders, meaning that HVs are not always restricted to bird host species. HV transmission could occur through bird predation or even superpredation. It was also found that small rodents are not a source of HV infections in owls, falcons, and birds of prey. The results of the research greatly expand the list of HV-susceptible host species of free-living birds and show that free-living birds with unknown infection status should be tested with a combination of oropharyngeal and cloacal swabs, which would maximize the probability of HV detection.

• Ključne besede: bird diseases – virology, Alphaherpesvirinae, herpesvirus infections – diagnosis – genetics – classification, polymerase chain reaction – methods, sequence analysis, DNA, phylogeny, Strigiformes