izpis_h1_title_alt

Izboljšava sistema za preurejanje genoma na osnovi CRISPR z uporabo obvitih vijačnic
ID Bohinc, Jure (Avtor), ID Forstneric, Vida (Mentor) Več o mentorju... Povezava se odpre v novem oknu, ID Murovec, Jana (Komentor)

.pdfPDF - Predstavitvena datoteka, prenos (2,34 MB)
MD5: 92D704F40BC5C2B3003433F3203E4F59

Izvleček
Sistem prime urejanja (PE) je strategija genomskega preurejana, pri kateri je mogoče brez dvojnoverižnih prelomov uvesti poljubno točkovno mutacijo na tarčno mesto v DNA. Temelji na fuziji nikaze Cas9 ter reverzne transkriptaze, povezanih preko peptidnega povezovalca. V tej nalogi predstavimo prilagojen sistem prime urejanja , ki zaobide potrebo po kovalentni povezavi posameznih proteinskih podenot. V nalogi pokažemo, da je posamezne proteine sistema ccPE možno pridobiti z rekombinantnim izražanjem v E. coli in da jih lahko do neke mere očistimo z uporabo gravitacijske Ni-NTA IMAC kromatografije ter gelske izključevalne FPLC kromatografije. S transfekcijo celic HEK293 s plazmidno obliko prilagojenega sistema prime urejanja in poročevalskim plazmidom pokažemo, da je uspešnost preurejanja na izbranem lokusu nekoliko višja od osnovnega sistema PE. Pri transfekciji celic HEK293 z ribonukleoproteinsko obliko prime edit sistema in poročevalskim plazmidom sistem ni kazal uspešnega preurejanja. V prihodnosti bi bilo potrebno optimizirati količine proteinskih in RNA komponent sistema za vnos v celice.

Jezik:Slovenski jezik
Ključne besede:CRISPR, Preurejanje genoma, Urejevalci prime
Vrsta gradiva:Magistrsko delo/naloga
Tipologija:2.09 - Magistrsko delo
Organizacija:BF - Biotehniška fakulteta
Leto izida:2022
PID:20.500.12556/RUL-139535 Povezava se odpre v novem oknu
COBISS.SI-ID:125235203 Povezava se odpre v novem oknu
Datum objave v RUL:04.09.2022
Število ogledov:1175
Število prenosov:72
Metapodatki:XML DC-XML DC-RDF
:
Kopiraj citat
Objavi na:Bookmark and Share

Sekundarni jezik

Jezik:Angleški jezik
Naslov:Improvement of the CRISPR Prime Edit System Using Coiled Coils
Izvleček:
Prime editing (PE) is a strategy for genome editing without creating double strand breaks. With prime editing it is possible to introduce any desired point mutation. It is based on the fusion of the Cas9 nickase and a reverse transcriptase. With this work we present a prime editing system based on non-covalent fusion of the protein components. We successfully expressed the N6-MMLVRT, nCas9-N5, nSpRY-N5, nCas9-MMLVRT and nSpRY-MMLVRT proteins in E. coli and were able to purify them to some degree using Ni-NTA gravity IMAC chromatography and using FPLC size exclusion chromatography. By transfecting HEK293 cells with the plasmid version of the non-covalent prime editors and a reporter plasmid we showed that this version achieved editing with greater efficiency than the classic PE system. Using ribonucleoproteins to edit the reporter plasmid showed no efficient editing. For future experiments amounts of proteins and epegRNAs would have to be optimized.

Ključne besede:CRISPR, Genome editing, Prime edit

Podobna dela

Podobna dela v RUL:
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:

Nazaj