Vaš brskalnik ne omogoča JavaScript!
JavaScript je nujen za pravilno delovanje teh spletnih strani. Omogočite JavaScript ali pa uporabite sodobnejši brskalnik.
Repozitorij Univerze v Ljubljani
Nacionalni portal odprte znanosti
Odprta znanost
DiKUL
slv
|
eng
Iskanje
Brskanje
Novo v RUL
Kaj je RUL
V številkah
Pomoč
Prijava
Podrobno
Strategija razvoja biosenzorjev imunskega odziva v krompirju
ID
Levak, Valentina
(
Avtor
),
ID
Gruden, Kristina
(
Mentor
)
Več o mentorju...
,
ID
Dolinar, Marko
(
Komentor
)
PDF - Predstavitvena datoteka,
prenos
(15,27 MB)
MD5: 924F2170555578DF2040725342C61812
Galerija slik
Izvleček
Kadar rastlina doživi stres, naj bo biotskega ali abiotskega izvora, v ogroženih celicah pride do imunskega odziva. Informacija o vrsti stresa se prenese med celicami s hormoni in drugimi signalnimi molekulami, ki nastajajo med celičnim imunskim odzivom. Imunski odziv lahko spremljamo v tkivu skozi čas preko aktivnosti promotorjev genov, ki so vključeni v regulatorno omrežje imunskega odgovora. Z izbiro promotorja gena iz določene signalne poti imunskega odziva lahko sledimo prostorsko-časovni dinamiki aktivacije izbranih genov in s tem širjenju imunskega odgovora. V magistrskem delu smo preverjali ustreznost treh metod za testiranje nativnih inducibilnih rastlinskih promotorjev po prehodni transformaciji tobaka Nicotiana benthamiana. Te metode so: kvalitativni test z glukuronidazo, kvantitativni test z luciferazo in konfokalna makroskopija. Ugotovili smo, da je test z luciferazo najprimernejši za ta namen, saj je hiter, občutljiv in ponovljiv ter omogoča spremljanje aktivnosti promotorja in vivo pri večjem številu vzorcev in skozi čas. Test smo nato optimizirali za naš namen. Reporterske proteine, ki smo jih uporabili za preverjanje metod, smo izražali pod kontrolo nativnih promotorjev genov PR1b, Pti5, MC in CPI8. Prvi trije so bili iz genomske DNA krompirja (Solanum tuberosum) že pomnoženi, promotorska zaporedja CPI8 pa smo pomnožili iz genoma kultivarjev krompirja Rywal in Désirée na podlagi referenčnega zaporedja podvrste Phureja ter analizirali predvidene cis-regulatorne regije. Aktivnost izbranih različic promotorjev CPI8 ob indukciji z jasmonsko kislino smo preverjali po prehodni transformaciji tobaka z optimiziranim luciferaznim testom. Različico, pri kateri je bilo izražanje luciferaze najmočnejše, smo izbrali za biosenzor signalne poti jasmonske kisline in ga bomo uporabili za stabilno transformacijo rastlin krompirja za nadaljnje proučevanje rastlinskega odziva na stres. Nova spoznanja o nastanku in razširjanju imunskega odziva pri rastlinah nam pomagajo razumeti potek rastlinskih bolezni in rastlinskega odgovora na kombinacije različnih stresorjev. To razumevanje je ključno pri pripravi novih, odpornejših sort.
Jezik:
Slovenski jezik
Ključne besede:
rastlinski imunski odziv
,
proteinazni inhibitor
,
luciferazni test aktivnosti promotorjev
,
jasmonska kislina
,
transkripcijska regulacija
Vrsta gradiva:
Magistrsko delo/naloga
Tipologija:
2.09 - Magistrsko delo
Organizacija:
FKKT - Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo
Leto izida:
2020
PID:
20.500.12556/RUL-119691
COBISS.SI-ID:
31298051
Datum objave v RUL:
10.09.2020
Število ogledov:
1531
Število prenosov:
261
Metapodatki:
Citiraj gradivo
Navadno besedilo
BibTeX
EndNote XML
EndNote/Refer
RIS
ABNT
ACM Ref
AMA
APA
Chicago 17th Author-Date
Harvard
IEEE
ISO 690
MLA
Vancouver
:
LEVAK, Valentina, 2020,
Strategija razvoja biosenzorjev imunskega odziva v krompirju
[na spletu]. Magistrsko delo. [Dostopano 4 maj 2025]. Pridobljeno s: https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?lang=slv&id=119691
Kopiraj citat
Objavi na:
Sekundarni jezik
Jezik:
Angleški jezik
Naslov:
Strategy for development of immune response biosensors in potato
Izvleček:
In biotic or abiotic stress, immune response is activated in affected plant cells. Information about the type of stress is shared between cells through hormones and other signal molecules synthesized in affected cells. Immune response can be followed through the activity of promoters of the genes that are involved in the immune response regulatory network. With the selection of a gene promoter from a specific immune response signaling pathway, we can track spatiotemporal dynamics of the activation of chosen genes and therewith, the expansion of the immune response. In this Master thesis, the applicability of three different methods for testing native inducible plant promoters after transient transformation of tobacco plants Nicotiana benthamiana was tested. These methods are: qualitative beta-glucuronidase assay, quantitative luciferase assay and confocal macroscopy. The luciferase assay was shown to be the most suitable for our purposes as it is fast, sensitive and repeatable and allows measuring of promoter activity in vivo in higher number of samples and through time. The assay was optimized in order to serve our purposes. Reporter proteins that were used in methods testing were expressed under control of native promoters of genes PR1b, Pti5, MC and CPI8. The first three had already been amplified from potato (Solanum tuberosum) genomic DNA, while promoter regions of CPI8 were amplified from the genome of cultivars Rywal and Désirée according to the reference sequence in Phureja subspecies. Afterwards, predicted cis-regulatory regions were analyzed in the amplified promoter regions. Actual activities of three chosen variants of CPI8 promoters were tested for inducibility to jasmonic acid after transient transformation of tobacco in the optimized luciferase assay. A variant that showed the highest luciferase expression was chosen for a biosensor of jasmonic acid signaling pathway and will be used for stable transformation of potato plants for further studies on plant stress response. New discoveries about the start and expansion of immune response in plants help us understand the course of plants’ diseases and response to the combination of different stressors. This understanding is key in the preparation of new, more robust plant cultivars.
Ključne besede:
plant immune response
,
proteinase inhibitor
,
luciferase test of promoter activity
,
jasmonic acid
,
transcriptional regulation
Podobna dela
Podobna dela v RUL:
Sodelovanje šolske svetovalne službe z otrokovo družino
Duševno zdravje srednješolcev v času epidemije covid-19
Socialno delo z otroki in mladostniki s posebnimi potrebami
Perspektive socialnega dela v srednji šoli
Vloga svetovalne službe v uvajalnem obdobju v vrtcu
Podobna dela v drugih slovenskih zbirkah:
Odnos dijakov do šolskega svetovalnega dela
Učno zavlačevanje pri srednješolcih
Varnost rabe mobilnih naprav med srednješolci
Sodelovanje šolske svetovalne službe in CSD pri preprečevanju nasilja v družini
Metode in tehnike supervizije svetovalnih delavcev v Pomurju in Mariboru
Nazaj